MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	GAAT	2	8	376	383	50 %	25 %	25 %	0 %	203288833
2	NC_011261	TCAA	2	8	480	487	50 %	25 %	0 %	25 %	203288833
3	NC_011261	AAT	2	6	548	553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
4	NC_011261	TAA	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
5	NC_011261	TAT	2	6	602	607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288833
6	NC_011261	A	7	7	609	615	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
7	NC_011261	TTA	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288833
8	NC_011261	AT	3	6	647	652	50 %	50 %	0 %	0 %	203288833
9	NC_011261	AAAT	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	203288833
10	NC_011261	ATG	2	6	727	732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288833
11	NC_011261	ACA	2	6	764	769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288833
12	NC_011261	A	6	6	782	787	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
13	NC_011261	CATAAA	2	12	804	815	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288833
14	NC_011261	GTCA	2	8	831	838	25 %	25 %	25 %	25 %	203288833
15	NC_011261	TAA	3	9	848	856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
16	NC_011261	A	7	7	855	861	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
17	NC_011261	ATA	2	6	865	870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288833
18	NC_011261	A	8	8	870	877	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
19	NC_011261	A	6	6	879	884	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
20	NC_011261	A	6	6	891	896	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
21	NC_011261	A	6	6	935	940	100 %	0 %	0 %	0 %	203288833
22	NC_011261	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288833
23	NC_011261	TAAA	2	8	1080	1087	75 %	25 %	0 %	0 %	203288833
24	NC_011261	A	8	8	1139	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	203288834
25	NC_011261	A	7	7	1157	1163	100 %	0 %	0 %	0 %	203288834
26	NC_011261	A	6	6	1171	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	203288834
27	NC_011261	T	7	7	1181	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	203288834
28	NC_011261	AG	3	6	1194	1199	50 %	0 %	50 %	0 %	203288834
29	NC_011261	AT	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
30	NC_011261	TAA	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288834
31	NC_011261	T	6	6	1282	1287	0 %	100 %	0 %	0 %	203288834
32	NC_011261	GA	3	6	1296	1301	50 %	0 %	50 %	0 %	203288834
33	NC_011261	ATTT	2	8	1331	1338	25 %	75 %	0 %	0 %	203288834
34	NC_011261	A	6	6	1395	1400	100 %	0 %	0 %	0 %	203288834
35	NC_011261	ATT	2	6	1429	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288834
36	NC_011261	AATTTA	2	12	1469	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
37	NC_011261	A	6	6	1480	1485	100 %	0 %	0 %	0 %	203288834
38	NC_011261	T	6	6	1493	1498	0 %	100 %	0 %	0 %	203288834
39	NC_011261	TA	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
40	NC_011261	TAT	2	6	1516	1521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288834
41	NC_011261	T	7	7	1521	1527	0 %	100 %	0 %	0 %	203288834
42	NC_011261	ATT	2	6	1563	1568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288834
43	NC_011261	ATA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288834
44	NC_011261	AT	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	203288834
45	NC_011261	GGA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288834
46	NC_011261	A	7	7	1655	1661	100 %	0 %	0 %	0 %	203288834
47	NC_011261	AAT	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288834
48	NC_011261	ATT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
49	NC_011261	ACT	2	6	1788	1793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288835
50	NC_011261	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	203288835
51	NC_011261	AGAGA	2	10	1814	1823	60 %	0 %	40 %	0 %	203288835
52	NC_011261	AAG	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288835
53	NC_011261	AT	3	6	1848	1853	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
54	NC_011261	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288835
55	NC_011261	TA	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
56	NC_011261	ATT	2	6	2092	2097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
57	NC_011261	CAG	2	6	2113	2118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288835
58	NC_011261	T	6	6	2154	2159	0 %	100 %	0 %	0 %	203288835
59	NC_011261	T	8	8	2188	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	203288835
60	NC_011261	TTA	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
61	NC_011261	ATA	2	6	2218	2223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288835
62	NC_011261	ATT	2	6	2234	2239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288835
63	NC_011261	T	6	6	2264	2269	0 %	100 %	0 %	0 %	203288835
64	NC_011261	ATA	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288835
65	NC_011261	TTTTGA	2	12	2324	2335	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203288835
66	NC_011261	TA	3	6	2343	2348	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
67	NC_011261	TTAA	2	8	2367	2374	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
68	NC_011261	T	7	7	2375	2381	0 %	100 %	0 %	0 %	203288835
69	NC_011261	ATTA	2	8	2388	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	203288835
70	NC_011261	TAA	3	9	2526	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288836
71	NC_011261	GAA	2	6	2536	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288836
72	NC_011261	A	6	6	2571	2576	100 %	0 %	0 %	0 %	203288836
73	NC_011261	TAA	2	6	2610	2615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288836
74	NC_011261	TAT	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288836
75	NC_011261	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	203288836
76	NC_011261	ATG	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288836
77	NC_011261	ATT	2	6	2735	2740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288836
78	NC_011261	GCA	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288836
79	NC_011261	AGA	2	6	2760	2765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288836
80	NC_011261	AGA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288836
81	NC_011261	A	6	6	2850	2855	100 %	0 %	0 %	0 %	203288836
82	NC_011261	CAAAA	2	10	2858	2867	80 %	0 %	0 %	20 %	203288836
83	NC_011261	T	6	6	2946	2951	0 %	100 %	0 %	0 %	203288836
84	NC_011261	ATT	2	6	2961	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288836
85	NC_011261	TAA	2	6	3462	3467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
86	NC_011261	TAA	2	6	3474	3479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
87	NC_011261	A	7	7	3486	3492	100 %	0 %	0 %	0 %	203288837
88	NC_011261	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288837
89	NC_011261	CAA	2	6	3517	3522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288837
90	NC_011261	TTA	2	6	3524	3529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
91	NC_011261	ATA	3	9	3566	3574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
92	NC_011261	GTAA	2	8	3586	3593	50 %	25 %	25 %	0 %	203288837
93	NC_011261	GAAT	2	8	3633	3640	50 %	25 %	25 %	0 %	203288837
94	NC_011261	GCT	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288837
95	NC_011261	AATT	2	8	3749	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	203288837
96	NC_011261	AAG	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288837
97	NC_011261	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	203288837
98	NC_011261	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288837
99	NC_011261	TATT	2	8	3864	3871	25 %	75 %	0 %	0 %	203288837
100	NC_011261	ATA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
101	NC_011261	TTG	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288837
102	NC_011261	CAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288837
103	NC_011261	TGGT	2	8	3981	3988	0 %	50 %	50 %	0 %	203288837
104	NC_011261	ATT	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
105	NC_011261	T	6	6	4086	4091	0 %	100 %	0 %	0 %	203288837
106	NC_011261	TGA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288837
107	NC_011261	AG	3	6	4209	4214	50 %	0 %	50 %	0 %	203288837
108	NC_011261	AAT	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
109	NC_011261	TGA	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288837
110	NC_011261	AGA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288837
111	NC_011261	ATT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
112	NC_011261	AATTA	2	10	4397	4406	60 %	40 %	0 %	0 %	203288837
113	NC_011261	TTAAA	2	10	4439	4448	60 %	40 %	0 %	0 %	203288837
114	NC_011261	A	6	6	4522	4527	100 %	0 %	0 %	0 %	203288837
115	NC_011261	AT	3	6	4589	4594	50 %	50 %	0 %	0 %	203288837
116	NC_011261	ATA	2	6	4628	4633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288837
117	NC_011261	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288837
118	NC_011261	TCG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288837
119	NC_011261	ATG	3	9	5006	5014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288838
120	NC_011261	TAA	2	6	5035	5040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288838
121	NC_011261	TAG	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288838
122	NC_011261	TAA	2	6	5125	5130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288838
123	NC_011261	GA	3	6	5158	5163	50 %	0 %	50 %	0 %	203288838
124	NC_011261	T	6	6	5174	5179	0 %	100 %	0 %	0 %	203288838
125	NC_011261	TAT	2	6	5187	5192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288838
126	NC_011261	GTT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288838
127	NC_011261	ATT	2	6	5315	5320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288838
128	NC_011261	CAT	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288838
129	NC_011261	TTCCTG	2	12	5382	5393	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288838
130	NC_011261	TCC	2	6	5395	5400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288838
131	NC_011261	AT	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	203288839
132	NC_011261	ACA	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288839
133	NC_011261	ATA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288839
134	NC_011261	TTA	2	6	5525	5530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288839
135	NC_011261	GTT	2	6	5547	5552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288839
136	NC_011261	ATT	2	6	5568	5573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288839
137	NC_011261	TAA	3	9	5617	5625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288839
138	NC_011261	TTA	2	6	5626	5631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288839
139	NC_011261	ATTAG	2	10	5639	5648	40 %	40 %	20 %	0 %	203288839
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269	NC_011261	AGG	2	6	11934	11939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288845
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